牧远联合安室透、怪盗基德、京极真一起，设计在琴酒与走私军火公司社长交易时实施抓捕。

伏特加再遭基德黑手，京极真假扮成走私公司社长，琴酒陷入绝境。

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贝尔摩德趁牧远对琴酒动手，组织实验室监察松懈之际对宫野志保动手，给她喂下了宫野爱莲娜制作的毒药（atx-4869前身），准备利用易容术，凭借宫野志保的指纹和虹膜潜入组织实验室，销毁atx-4869的相关研究资料。

千钧一发之际，收到宫野志保催促短信的毛利兰赶到。

贝尔摩德不忍心伤害毛利兰，用出了人体描边枪法，放任两人逃入了海水中。

警方即将抵达，贝尔摩德变装成一位交番的巡查警员离去。

水中，吃下毒药的宫野志保即将窒息，善良的毛利兰毫不犹豫地将自己肺里的空气度给了宫野志保，并亲眼见证了宫野志保变小，灰原哀的诞生。

救命之恩让宫野志保对毛利兰大为改观，甚至暗中将毛利兰与自己的姐姐宫野明美做过比较。

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另一边，热带乐园中，柯南本已逃脱了变小的命运，但由于怀疑牧远对毛利兰有意思、跟踪两人来到热带乐园，从而对牧远展开了反跟踪，被牧远用一记手刀打晕。

琴酒凭借着惊人的直觉与洞察力，感知到了不远处柯南倒下时的动静，柯学时间线再次降临，身为穿越者的牧远因不能良好融入而感觉到了晕车般的眩迷感，昏倒在地。

琴酒喂柯南吃下atx-4869，时间线闭环。

牧远恢复意识，看到了变小的柯南，终于意识到自己所穿越的世界，就是他前世养肥了好久，本想等点亮心圆后再看的热门动漫——《名侦探柯南》。

柯南剧情正式开始。

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闭合的时间线让柯南世界中的所有人都不会再变老，但牧远除外。

牧远不能确定，这种全世界只有自己会衰老的情况，会不会在他点亮心圆后，对他的心态产生影响，从而导致心圆出现裂痕甚至崩塌，为了以防万一，他选择保护柯南的主线剧情发展，确保在他找不到灰原哀时，灰原哀按照原本剧情自己主动出现。

（牧远对柯南剧情的了解程度，仅仅只是主线的大致方向，以及某几个关键的剧情节点而已。）

因而，牧远化身为面具斗篷人，救下了即将被京极真揍趴下的琴酒。

京极真认出了牧远，并以武道家、真男人的判断方式认可了牧远的气势，判断出牧远一定是有不得不救下琴酒的理由的，并没有加以追问，但出言道：“如果再次遇到琴酒，他是不会手下留情的。”

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各人当前状况：

牧远：决定在确保柯南主线剧情不变的情况下，尝试着在组织内部找到atx-4869的制作者灰原哀。

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宫野志保：变成了灰原哀，知道牧远和姐姐如果直到了她的情况，一定会竭尽全力的保护她，所以为了保护牧远和姐姐，决定听从阿笠博士的劝告，向两人隐藏自己的身份，并计划着用自己的方式保护两人。

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柯南：听过阿笠博士的简单介绍，推理出了牧远和灰原哀都是组织的人，但并不是敌人，并由于灰原哀不愿意配合他对抗黑衣组织，从而决定继续留在小兰家，通过毛利侦探事务所的信息优势，寻找其他和组织有关的线索。