原来虽然清廷终止了和南京的贸易来往，但北方对南方商品的需求很大，由其是八旗贵族，对南方的丝绸、瓷器、玻璃制品的需求极大，因此一直存在走私贸易，来弥补没有正常贸易的缺陼，而且边线的驻军也从中有利可图，也给走私商人大开方便之门，清廷也不更多管，对此也只能睁一眼闭一眼不管。而商毅为了方便北方的情报需入，也开避了专门的走私通道。南北的走私来往，依然非常频繁。
于是钱谦益和柳如是商议决定，这次让柳如是随走私商人偷入南方。
但就在这时，商毅下达了对清宣战的诏书，以及劝原明官员反正南归。钱谦益得知以后，也不禁大喜，因为这就等于是得商毅的保证了，毕竟这是向全天下公开发布的诏书，钱谦益还是相信商毅会尊守信用的。于是也立刻改变主意，决定抛弃家业，和柳如是一起南返。
结果钱谦益和柳如是跟随走私商人，由汝宁府到达光州，进入南京政府的管辖区内。钱谦益立刻找到守军，表明了自巳的身份。而光州守军，也立刻向南京报告了此事。
商毅接到报告之后，也颇为感慨。在另一时空里的钱谦益是个思想和性格都比较复杂的人。由其是在晚年的时候，完全处于进退维谷、反复无常的尴尬状态，结果既为明朝遗民所斥责，又为清朝皇帝所憎厌。据一些史料记载，在降清之后，钱谦益确实在暗中与西南和东南海上反清复明势力联络，并资助过他们抗清的经费，而且在他临死前还呼喊着：“当初不死在乙酉日（弘光朝廷灭亡的时候），这不是太晚了吗？”。
其实钱谦益可以说是这个时代文人的一个典型代表，在他身上，反映了明清之际一些文士人生态度的矛盾纠结。他们都自视很高，但在国难之际，却拿不出有效的应对方法；以维护传统道德为己任，但又不乏晚明文人纵情放诞的习气；平素都是以清流面貌自居，道貌岸然，但却因为热衷于功名，不仅助长了南明的党争，而且还使自已屡次陷入各种政治漩涡；虽然也知道气节道义，但到了生死关头，却又没有杀身成仁、舍生取义的勇气，只能留下降清失节的污名；而在降清之后，由于不得志，和传统道德观念，于是又想反正南归，力图重建自己的人生价值。
当然在本时空里，钱谦益反正南归，还是得到不少人的支持，因为不管钱谦益的人品如何，但学问渊博，由其是在文学上的成就，在明清交际的时代，确实是首屈一指，其诗作文辞十分优美，应该说已经达到了时代的顶峰。在钱谦益表示了南归的意向之后，黄宗羲、方以智、陈慧贞、冒避疆等人都表示欢迎，不仅是出于旧友之谊，同时也确实是可惜钱谦益的才学。
因此在得到钱谦益己经南归的确切消息之后，也有不少人向商毅进言，劝他接纳钱谦益，除了南京的一些原明官员之外，还有郑成功也给商毅写信，帮钱谦益说好话，因为钱谦益还曾是郑成功的老师。
其实商毅对钱谦益反正南归之举，也是非常欢迎，因为这是宣战诏书发布之后，第一个作出响应的原明官员，这个意义相当重要。而且钱谦益并不是一个普通人，在南方，乃致全国都据有相当的影响力，另外商毅建立的是一个新朝，在这一点上来说，钱谦益背明降清，现在又反清南归，并不是不能接受的。当然商毅仍然还是那个大前捉，回到南京来，别给自已捣乱，当然这个任务还是交给陈圆圆去完成。
因此南京内阁和参政院先后发表声明，对钱谦益南归表示了欢迎，同时商毅也让黄宗羲和史可法去迎接钱谦益到南京来，并且又亲自在王府接见钱谦益，而陈圆圆也私下邀请柳如是入宫述旧。
当然商毅对钱谦益的降清行为并没有回避，直接指出，降清行为将是钱谦益一生的污点，但也表示，过去的事情虽然无法改变了，但也希望钱谦益能够在南京代罪立功，以后多做一些于国于民有益的事情，弥补自己的过失。虽然被商毅说得又羞又愧，甚致是痛哭流涕，但钱谦益也十分感激，向商毅称谢不已。
随后内阁又下文，任命钱谦益为南京文史馆撰修，付责整理古籍资料，并兼任师范大学教授。虽然在宣战招书中，商毅表示对反正官员授予官职，但肯定不会是重要职位，动员清廷汉官反正，目地是瓦解清廷，而不是真得要重用这些人，其像征意义更大于实际意义，但毕竟属于政治上有污点的人，不可能出任要职，别说是内阁、各部，就是参政院也不会录用，只能出任闲职。如钱谦益这样学问渊博的人，正好可以干一些文化方面的事情，政治就别在参和了。
不过经历了这一番大起大落大反复之后，钱谦益也看开了，这次南归也只是求一个心安，并没有什么追求功名的想法，干文化方面的事情，教书育人，也正合钱谦益的心意。因此也十分愉快接受了这一任命。
而在回家之后，柳如是也将自己和陈圆圆述旧中，听陈圆圆转达的情况也转告给钱谦益。这一点钱谦益还是非常明白的，于是就在当天晚上，钱谦益连夜写了一篇 认错的文章，并且再次呼吁清廷的汉官，尽快反正南归，在《杭州时报》上公开发表。并且在以后的时间里，钱谦益不仅没有在过问政治，也写了不少为商毅歌功颂德，赞扬南京政府的诗辞文章。
钱谦益的反正南归，在清廷内部确实又引起了极大的反应。其实是大多数的汉族官员也确实和钱谦益的情况差不多，虽怨并非完全甘心降清，但心里充满了矛盾，当然如果清廷的统治稳固，又是施行善待汉人的政策，也许有不少官员也就算了，一心一意的扶保清廷，也未必就会轻易弃清归南，但本来清廷就是抑汉兴满，而现在确实是内外交困之中，不少人都意识到，现在这个时候，这条大船确实很有可能面临沉没，也应该为自己的后路着想，加上这时又冒出了一个反正南归的钱谦益，因此也确实有不少人都开始盘算，自己是不是也应该准备归南了。
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